El Consejo Escolar es el órgano colegiado de gobierno a través del cual participa la comunidad educativa en el gobierno de la EOI. Sus miembros son el presidente, que es el director del centro, la jefe de estudios, la secretaria, ocho representantes del profesorado, tres representantes de los padres o tutores legales, cinco representantes del alumnado, un representante del personal de administración y servicios y un representante del Ayuntamiento. La composición del Consejo Escolar se somete a elecciones cada dos años.